潔凈室系統控制的核心是壓差。如果壓差控制不好，非潔凈室的空氣會被導入潔凈室，對我們的凈化系統，比如初、中、高效過濾器，客戶的產品都會造成一定的損害。
為什么會這樣？因為潔凈車間的塵粒通過三級過濾進入車間，分布到各個角落，再通過回風口回收室內空氣進行過濾。系統是一個循環的凈化系統，任何一個環節出現問題都會對系統造成一定的影響，所以要保證沒有一個。
以下是潔凈室壓差參數：
壓力差
相鄰潔凈區房間的壓差應為10-15帕斯卡(指導值)。- EUcGMP
潔凈區和非潔凈區之間以及不同等級的潔凈區之間的壓差應不小于10帕斯卡。相同潔凈度等級、不同功能的手術室之間應保持適當的壓差梯度，防止污染和交叉污染。-中國的新GMP
相鄰潔凈區之間的壓差應為12.5帕斯卡-FDA。
氣流自凈
應該證明不存在各種空氣流動方式造成污染的風險。例如，應采取適當的措施，確保氣流不會將操作或設備和操作人員排放的顆粒吹到高潔凈度要求的區域。所有操作結束后，操作人員應離開生產現場，進行15 ~ 20分鐘的自清潔(指導值)，清潔區域應達到“靜態”標準。
